כשבועיים אחרי הפיגוע: חוסלו שניים מהמחבלים שרצחו 3 באזור קדומים
במסגרת פעילות כוחות הביטחון בג'נין, לוחמים ביצעו "סיר לחץ" על מבנה בכפר בורקין וחיסלו שניים מהמחבלים שרצחו שתי נשים וגבר בפיגוע בפונדוק. צה"ל: המחבלים - תושבי קבאטיה המזוהים עם הג'יהאד האסלאמי. לוחם נפצע באורח בינוני במהלך חילופי האש
צה"ל אישר הבוקר (חמישי) כי במסגרת מבצע "חומות ברזל" של כוחות הביטחון באזור ג'נין חוסלו שניים מהמחבלים שרצחו את רס"ר אלעד וניקלשטיין, רחל כהן (73) ועליזה רייז (70) בפיגוע הירי בכפר פונדוק לפני כשבועיים וחצי. במסגרת הפעילות שהובילה לחיסול נפצע לוחם צה"ל באורח בינוני, והוא פונה לקבלת טיפול רפואי בבית חולים.
לפני החיסול, הלוחמים פתחו בנוהל "סיר לחץ" על מבנה בכפר הפלסטיני בורקין בו התבצרו שני המחבלים - שחוסלו לאחר חילופי אש שנמשכו שעות. מצה"ל נמסר כי המחבלים שחוסלו הם מחמד נזאל וקתיבה שלבי, תושבי קבאטיה המזוהים עם הג׳יהאד האסלאמי. עוד נמסר כי במהלך הפעילות נעצרו לחקירת שב״כ מספר מחבלים נוספים שסייעו למבצעי הפיגוע. כעת נמשך המרדף אחר המחבל השלישי שלקח חלק בביצוע הפיגוע.
שר הביטחון ישראל כ"ץ מסר: "מברך את כוחות צה"ל על הסיכול הלילה של 2 מהמחבלים שביצעו את פיגוע הרצח הנתעב בפונדוק. כל רוצח או נותן חסות לרצח וטרור ישלם את מלוא המחיר. נמשיך לפעול בעוצמה במבצע 'חומת ברזל' לסיכול המחבלים והרס תשתיות הטרור במחנה הפליטים ג'נין - ונוודא שלא ישוב להיות קן מרצחים וחממה לפיגועי טרור".
בפיגוע בו נרצחו רס"ר וניקלשטיין, חוקר משטרה בתחנת אריאל, רחל כהן ועליזה רייז, שתיהן תושבות קדומים עבדו בעבר כיועצות חינוכיות, נפצעו 11 בני אדם נוספים בדרגות שונות, בעקבות ירי המחבלים לעבר אוטובוס ושני כלי רכב שנסעו דרך פונדוק.
רס"ר וניקלשטיין, תושב עין הנצי"ב שהיה בעבר רבש"ץ קדומים, הותיר אחריו את רעייתו טל ושני ילדים: "גיבור ישראל. הספיק לירות על המחבלים שני כדורים, נפגע מכדור - ונרצח". בנו בן ה-8.5 היה עימו ברכב בזמן הירי - אך לא נפגע.
ממועצה מקומית קרני שומרון, בה התגורר רס"ר וניקלשטיין, נמסר לאחר הפיגוע: "אלעד היה תושב המועצה במשך שנים רבות, ומשפחתו המורחבת מתגוררת אף היא בקרני שומרון. אנו משתתפים בצערם של ההורים נעמי ויוסי וינקלשטיין, אשתו טל, הילדים נווה ועומר, ואחיו יונתן, הדס והראל. צוותי המועצה מלווים כעת את בני המשפחה המתגוררים בקרני שומרון".
רחל כהן, בת 73, התגוררה בקדומים, והייתה יועצת חינוכית עד ליציאתה לפנסיה. היא הותירה אחריה בעל וחמש בנות. ביתה נעמי סיפרה: "אימא הייתה אישה מלאת שמחה, חסד ואנרגיה חיובית. שידרה טוב על כולם, מלאת אמונה ויראת שמיים וסבתא ואמא פעילה ואהובה. היא הכתובת המשפחתית שלנו לכל דבר ולכל עניין. היא הייתה אמא ואישה מלאה בעומק ובאהבה. אישה מיוחדת ומרגשת, מלאה באור של חסד ורחמים שבחרה תמיד לראות טוב בחייה וככה היא חינכה אותנו. היו לה תוכניות רבות לפניה, היא דאגה כל השנים לעזור להמון אנשים, נערים ונערות, היא הייתה אוזן קשבת לכולם ללא יוצא מן הכלל. והכל מתוך אהבה ואופטימיות".
עליזה רייז, בת 70, התגוררה גם היא בקדומים, ועבדה כיועצת חינוכית. היא הותירה אחריה ילדים ומשפחה. בנה יאיר ספד לה: "בשבוע הבא תכננו לעשות לה יום הולדת 70 בהפתעה, היא הייתה אישה גדולה מהחיים, שעשתה הכל ב-10 אצבעותיה, כמו רבי עקיבא, רק בגיל 40 התחילה ללמוד באוניברסיטה ולא ויתרה. שום דבר לא עמד מולה. היה לה כוח רצון ועקשנות שהובילה אותה לעשות דברים גדולים בכל תחום. אמא הייתה אישה חזקה שחושבת על כולם. הייתה ממקימות קדומים, התנדבה במסירות במשמר האזרחי. והייתה יועצת חינוכית בחסד עליון, שלא ויתרו עליה גם אחרי שיצאה לפנסיה. ראתה רק טוב בכל אדם. אהבה לחיות ואהבה את החיים ואת המשפחה יותר מכל".
מתחקיר הפיגוע עולה כי האוטובוס, שבו היו אזרחים ישראלים, נסע בכביש 55 - שחוצה את הכפר הפלסטיני פונדוק - ואז החל הירי. נהג האוטובוס, בן 63, במצב קשה ונשקפת סכנה לחייו; אישה נוספת כבת 60 במצב בינוני-קשה ועוד 9 במצב בינוני וקל. לבית החולים מאיר בכפר סבא פונה פצוע במצב קשה ועוד שישה, בהם אחד במצב בינוני. לבית החולים בילינסון בפתח תקווה פונו שני פצועים במצב בינוני וקל. המחבלים המשיכו בנסיעה ופתחו באש לעבר שני כלי רכב נוספים ולאחר מכן נמלטו. צה"ל ושב"כ פתחו במצוד אחר המחבלים, שכנראה ברחו לאזור שכם.